Per la mia esperienza a SD da vedere c'è sicuramente lo Zoo, Point Loma nella zona dove hai l'albergo merita una visita, la spiaggia di Coronado con relativo Hotel, Balboa Park, la Uss Midway, il Petco Park, con queste già ti riempi i 2 giorni a disposizione, anzi forse dovrai escludere qualcosa.
Evita di andare a Tijuana e a Old Town, non ne vale la pena.
Passando se puoi fermati a La Jolla, a me è piaciuta molto
Ti innamorerai di San Diego, a mio parere come clima e qualità della vita la migliore città degli Usa